Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPE9

Atp13a1, Manganese-transporting ATPase 13A1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a1Q9EPE9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a1Q9EPE9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp13a1Q9EPE9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp13a1Q9EPE9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp13a1Q9EPE9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp13a1Q9EPE9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atp13a1Q9EPE9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms