Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndufs3Q9DCT2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndufs3Q9DCT2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ndufs3Q9DCT2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ndufs3Q9DCT2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms