Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cbx6Q9DBY5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cbx6Q9DBY5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cbx6Q9DBY5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cbx6Q9DBY5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cbx6Q9DBY5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms