Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SrpraQ9DBG7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SrpraQ9DBG7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrpraQ9DBG7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrpraQ9DBG7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms