Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Jam3Q9D8B7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Jam3Q9D8B7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Jam3Q9D8B7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Jam3Q9D8B7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms