Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Capn9Q9D805 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Capn9Q9D805 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Capn9Q9D805 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Capn9Q9D805 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms