Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W4

Tspan17, Tetraspanin-17, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan17Q9D7W4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tspan17Q9D7W4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tspan17Q9D7W4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tspan17Q9D7W4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tspan17Q9D7W4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tspan17Q9D7W4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms