Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Chmp4cQ9D7F7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Chmp4cQ9D7F7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Chmp4cQ9D7F7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Chmp4cQ9D7F7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms