Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D7E4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D7E4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D7E4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q9D7E4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q9D7E4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q9D7E4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms