Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc94Q9D6J3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc94Q9D6J3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc94Q9D6J3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms