Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Speer4f1Q9D5Q6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Speer4f1Q9D5Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Speer4f1Q9D5Q6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Speer4f1Q9D5Q6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms