Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zc2hc1bQ9D534 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zc2hc1bQ9D534 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Zc2hc1bQ9D534 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms