Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Y3

Rhox2a, Reproductive homeobox 2A, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox2aQ9D4Y3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Rhox2aQ9D4Y3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rhox2aQ9D4Y3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rhox2aQ9D4Y3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rhox2aQ9D4Y3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms