Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
4933402E13RikQ9D4D2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
4933402E13RikQ9D4D2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4933402E13RikQ9D4D2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
4933402E13RikQ9D4D2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
4933402E13RikQ9D4D2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4933402E13RikQ9D4D2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
4933402E13RikQ9D4D2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
4933402E13RikQ9D4D2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms