Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H9

Dnaaf1, Dynein assembly factor 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf1Q9D2H9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dnaaf1Q9D2H9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dnaaf1Q9D2H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Dnaaf1Q9D2H9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Dnaaf1Q9D2H9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms