Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim42Q9D2H5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trim42Q9D2H5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim42Q9D2H5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim42Q9D2H5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms