Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chordc1Q9D1P4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Chordc1Q9D1P4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Chordc1Q9D1P4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Chordc1Q9D1P4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms