Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lsm12Q9D0R8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsm12Q9D0R8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lsm12Q9D0R8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lsm12Q9D0R8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lsm12Q9D0R8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms