Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R4

Ddx56, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx56Q9D0R4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx56Q9D0R4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx56Q9D0R4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ddx56Q9D0R4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ddx56Q9D0R4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ddx56Q9D0R4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ddx56Q9D0R4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms