Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srsf9Q9D0B0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Srsf9Q9D0B0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srsf9Q9D0B0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms