Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Mms19Q9D071 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mms19Q9D071 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mms19Q9D071 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mms19Q9D071 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms