Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nde1Q9CZA6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nde1Q9CZA6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Nde1Q9CZA6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Nde1Q9CZA6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nde1Q9CZA6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms