Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl11Q9CXW4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rpl11Q9CXW4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rpl11Q9CXW4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms