Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BccipQ9CWI3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BccipQ9CWI3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
BccipQ9CWI3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BccipQ9CWI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BccipQ9CWI3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms