Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NubplQ9CWD8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NubplQ9CWD8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NubplQ9CWD8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NubplQ9CWD8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms