Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fcf1Q9CTH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fcf1Q9CTH6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fcf1Q9CTH6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Fcf1Q9CTH6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fcf1Q9CTH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms