Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
1700029F12RikQ9CRB4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700029F12RikQ9CRB4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700029F12RikQ9CRB4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms