Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA9

Fgfr1op2, FGFR1 oncogene partner 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1op2Q9CRA9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fgfr1op2Q9CRA9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fgfr1op2Q9CRA9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fgfr1op2Q9CRA9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fgfr1op2Q9CRA9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fgfr1op2Q9CRA9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms