Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc96Q9CR92 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc96Q9CR92 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc96Q9CR92 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc96Q9CR92 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms