Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR16

Ppid, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpidQ9CR16 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PpidQ9CR16 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PpidQ9CR16 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PpidQ9CR16 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PpidQ9CR16 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms