Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psmd9Q9CR00 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Psmd9Q9CR00 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Psmd9Q9CR00 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psmd9Q9CR00 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms