Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ykt6Q9CQW1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ykt6Q9CQW1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ykt6Q9CQW1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ykt6Q9CQW1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms