Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smim8Q9CQQ0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smim8Q9CQQ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smim8Q9CQQ0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smim8Q9CQQ0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms