Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
1700029P11RikQ9CQ68 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
1700029P11RikQ9CQ68 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
1700029P11RikQ9CQ68 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
1700029P11RikQ9CQ68 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms