Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4921530L21RikQ9CQ47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
4921530L21RikQ9CQ47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4921530L21RikQ9CQ47 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4921530L21RikQ9CQ47 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms