Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC27Q9C0I9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC27Q9C0I9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRRC27Q9C0I9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRRC27Q9C0I9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms