Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZCCHC2Q9C0B9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZCCHC2Q9C0B9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZCCHC2Q9C0B9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZCCHC2Q9C0B9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms