Protein–RNA interactions for Protein: Q9C040

TRIM2, Tripartite motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM2Q9C040 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM2Q9C040 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRIM2Q9C040 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM2Q9C040 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM2Q9C040 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms