Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRIM5Q9C035 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRIM5Q9C035 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TRIM5Q9C035 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TRIM5Q9C035 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms