Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BCO2Q9BYV7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BCO2Q9BYV7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
BCO2Q9BYV7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BCO2Q9BYV7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BCO2Q9BYV7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms