Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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