Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NIFKQ9BYG3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NIFKQ9BYG3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NIFKQ9BYG3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NIFKQ9BYG3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.2 ms