Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
PCGF6Q9BYE7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
PCGF6Q9BYE7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.07■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
PCGF6Q9BYE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PCGF6Q9BYE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PCGF6Q9BYE7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC37.93■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PCGF6Q9BYE7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms