Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ACTRT3Q9BYD9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTRT3Q9BYD9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ACTRT3Q9BYD9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ACTRT3Q9BYD9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms