Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
SCAPERQ9BY12 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
SCAPERQ9BY12 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
SCAPERQ9BY12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
SCAPERQ9BY12 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SCAPERQ9BY12 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.87■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SCAPERQ9BY12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms