Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SNHG12Q9BXW3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SNHG12Q9BXW3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SNHG12Q9BXW3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms