Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS6

NUSAP1, Nucleolar and spindle-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUSAP1Q9BXS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NUSAP1Q9BXS6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NUSAP1Q9BXS6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NUSAP1Q9BXS6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms