Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.66
SYCP2Q9BX26 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYCP2Q9BX26 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
SYCP2Q9BX26 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
SYCP2Q9BX26 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
SYCP2Q9BX26 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
SYCP2Q9BX26 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms