Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAIPQ9BWF2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAIPQ9BWF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAIPQ9BWF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms