Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW61

DDA1, DET1- and DDB1-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDA1Q9BW61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DDA1Q9BW61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDA1Q9BW61 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DDA1Q9BW61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDA1Q9BW61 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms